中医认为，便秘病位在大肠，病机在脾和肝。《素问·灵兰秘典论篇》曰：“大肠者，传道之官，变化出焉。”故粪便的排出与大肠功能关系密切。《诸病源候论·小儿杂病诸候论》曰：“小儿便不通者，脏腑有热，乘于大肠故也。”
小儿脾常不足，一方面是因为小儿生而未全、全而未壮，故其脏腑功能较弱，另一方面还因其处于旺盛的生长发育期，对水谷精气的需求比成人相对高，而小儿脾气尚弱，存在着运化功能不健的现象。若饮食调摄不当、情志变化，则易造成脾胃虚弱、运化无权，脾升胃降失常，浊阴不降，影响大肠气机，致传导功能低下，糟粕内留而便秘。
肝主疏泄，能调畅全身气机，且能促进脾胃的运化功能和大肠传导功能，以助大便排泄。小儿的生理特点为肝常有余，生机勃发，其气机升多降少，糟粕不易顺降而郁滞肠腑，故便秘者多;肝气郁结，疏泄不畅，气机壅滞，同时也影响了脾的运化，大肠气行不畅，传导失司，糟粕留滞，而成便秘。
推拿治疗
对于服药困难或不愿服药的患儿，采用推拿手法也能取得较好疗效。
以脾虚为主的患儿，多见面色白而无华，形疲乏力，大便努挣难下，便质不干，舌淡苔薄，指纹色淡。治宜益气养血，开塞通便。主要采用以下手法：
1、补脾：脾经位于拇指桡侧缘。操作时，由指根尖推向指根300次。能调理脾胃，加强脾胃运化功能。
2、推三关：位于前臂桡侧，太渊穴至曲池穴成一直线。操作时，自下向上推100～500次。具有温里散寒、温补气血之功效，适用于各种虚证，如身体虚弱、神疲气怯、面色无华等。
3、捏脊：从第一胸椎至尾椎，由下往上捏30遍。可调阴阳、理气血、和脏腑、通经络，凡脾胃虚弱之证，均可用之。
以肝实为主的患儿，症见大便干结，便质干硬，形似颗粒，面赤身热，口臭，唇赤，小便黄，胸胁痞满，纳食减少，腹部胀，苔黄厚，指纹色紫。治宜顺气行滞，清润通便。主要采用以下手法：
1、清大肠：大肠穴位于食指桡侧缘。操作时由虎口推向指尖，100～300次。能治疗湿热、饮食、痰饮等停积肠道、气机受阻之便秘、腹中灼痛等。
2、退六腑：六腑位于前臂尺侧缘，神门穴至肘成一直线。操作时，以中食指指腹，自肘关节推至掌根，100～500次。能通腑泻热，滑肠泻下，用于阳明腑实之痞满燥实坚。
3、补肾水：位于小指螺纹面。操作时，自小指根推至小指尖100次。有补肾固本，清热利尿之功效。
4、泻肝火：找准血海穴(双膝内侧)用双手拇指按摩40次左右。